转录组广义上指特定细胞在某一功效状态下的所有转录产物，包罗mRNA 和非编码RNA（ncRNA）。是毗连基因组遗传信息与生物功效的一定纽带。真核生物转录组测序基于高通量测序，可快速获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的所有转录本的荟萃，用于研究基因结构和基因功效、可变剪接和新转录本展望等。
转录组研究能够从整体水平研究基因功效以及基因结构，已经成为展现生物生长发育调控和逆境胁迫顺应机制、生物进化纪律、疾病发生生长的主要机制以及发现致病基因调控的关jian靶点等方面的优先研究手段，现在已普遍应用于基础研究、临床诊断和药物研发、动植物育种等各个领域。
欧宝组学优势
1.全流程服务： 提供从生物样品到可视化数据的全套组学服务；
2.富厚项目履历：具备处置赏罚重大样本的能力，同时具有富厚的建库履历；
3.流程化剖析：完善的剖析流程，准确快速剖析组学数据；此外可团结客户的需求无邪举行定制化信息剖析；
4.专业化团队：资深科学照料具有富厚的方案设计、售后服务履历，全程一对一相同；
5.一站式解决方案：拥有一站式多组学服务，助力基础研究及临床治疗。
样本起shi量与送样建议
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样本类型 |
起shi量 |
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动物及临床脏器组织/脑组织等 |
>20mg |
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动物及临床皮肤/骨/血管/脂肪组织等 |
>100mg |
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植物叶片组织/花 |
>200mg |
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植物根/茎/果实/种子 |
>500mg |
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原代细胞/细胞系 |
>5×106个 |
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中性粒细胞/嗜酸性粒细胞/嗜碱性粒细胞 |
>5×107个 |
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总RNA |
>1μg且RIN>7.0 |
注重事项：
① 组织样本建议生涯在RNAlater、RNAHold、RNAProtect等相关组织生涯液中，然后-80℃生涯或干冰寄送；
② 细胞样本使用TRIzol等裂解液充实裂解之后，-80℃生涯或干冰寄送；
③ 越发详细的样本准备指南，请联系在线客服。
生物信息学剖析内容
应用chang景
应用chang景1：差异基因筛选与功效剖析
适用规模：临床医学、基础医学、生物化学、动植物及真菌研究等恣意偏向
使用真核有参转录组测序，可通过较量实验组和对照组基因表达量筛选差异表达的基因。然后对差异表达基因举行进一步锁定，如通过GO、KEGG富集剖析及GSEA剖析，配合Pubmed中已揭晓的文献以及课题组中已积累的部门明星分子对差异表达基因举行功效注释，并进一步剖析关注的功效基因。进入实验验证阶段后可对筛选到的差异基因举行qPCR、Northern、Western Blot、FISH验证、基因敲除及过表达等。
应用chang景2：时序剖析或浓度梯度剖析
适用规模：临床样本、细胞样本、动植物样本有多个时间段的样本，或差异药物浓度处置赏罚的样本
在转录组数据剖析历程中，有一类特殊的实验设计。通过对差异时间段的实验样本举行搜集，或测试差异的药物、试剂等浓度梯度的样本举行收罗。继而研究差异基因在差异时间段或差异浓度梯度间的表达纪律，这一类剖析通常称之为“时序剖析”
应用chang景3：转录因子/调控因子/剪切因子等上游调控基因挖掘
适用规模：临床医学、基础医学、生物化学、动植物研究等恣意研究偏向
通例转录组差异剖析极有可能获得大量的差异基因，这对后期实验验证的目的锁定带来挑战。在没有特定感兴趣的通路及明星分子条件下，转录因子是一个很是不错的切入偏向。转录因子可以调治基因组DNA开放性、召募RNA聚合酶举行转录历程、召募辅助因子调治特定的转录阶段，调控诸多生命历程，诸如免疫反映、发育模式等。以是，剖析转录因子表达及其调控活性对于剖析重大生运气动具有主要意义。其他调治因子包罗可变剪切等调控基因也可以加入上游调控。
应用chang景4：大样本研究
适用规模：动植物育种、遗传群体与物种起源、人群行列与生物标志物挖掘
随着测序手艺的飞速生长，少量样本的转录组测序研究已经无法诠释重大的生物学问题。研究者们已开shi使用大样本量的转录组样本，团结统计学与机械学习等方式，知道切合特定纪律和研究目的的焦点基因。如孟德尔随机化、相关性剖析、线性回归、LASSO回归、Cox回归等，剖析差异样本基因或基因组多样性，挖掘更深入和周全的生物学意义。
项目文章
【1】Liang H, et al. Siglec15 facilitates the progression of non-small cell lung cancer and is correlated with spinal metastasis. Ann Transl Med. 2022 Mar;10(6):281. PMID: 35434017.
【2】Pi Y, et al. The role of PIWI-interacting RNA in naringin pro-angiogenesis by targeting HUVECs. Chem Biol Interact. 2023 Feb 1;371:110344. PMID: 36623717.
