10x Genomics Visium将基因空间表达可视化，在识别差异细胞群的同时保留空间配景，提供了关于组织微情形中细胞功效、表型和位置关系的关jian信息，为基因表达和组织重大性研究提供了一个新视角。
将冰冻组织切片放置在10X Genomics Visium芯片的的捕捉区域内，举行HE染色和成像后，对组织切片举行透化处置赏罚，细胞内的mRNA释放，从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕捉，而且每个探针都带有特异的地址序列，然后以mRNA为模版举行cDNA合成，构建文库后举行测序，从而能够获得基因表达的位置信息。
Visium空间基因表达玻片信息
Visium芯片有4个捕捉区域，每个区域巨细为6.5mm *6.5mm，每个spot直径为55um，包罗数百万个用于捕捉的oligo探针序列，相邻两个spot点的中心距离为100um。探针序列的结构为：测序引物团结序列，16 nt spatial barcoded，12 nt UMI及30 nt oligo-dT序列。
样本起shi量与送样建议
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组织类型 |
样本网络 |
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OCT包埋冰冻组织/白片/切片 |
制备 OCT包埋冰冻组织块，建议组织巨细为长×宽不凌驾 6.5mm×6.5mm，高度≥5mm；
白片或贴片建议准备6-13 片（10μm 厚度）。
封装好用干冰举行寄送。 |
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FFPE包埋组织/白片/切片 |
石蜡包埋组织封装好后，4℃举行寄送。
石蜡包埋白片或贴片建议准备6-13 片（5μm 厚度），4℃举行寄送。 |
注重事项：详细样本准备指南，请联系在线客服。
生物信息学剖析内容
